Zero Interaction Potency
简介Zero Interaction Potency (ZIP)零相互作用模型可用于化合物/药物组合研究。该模型假定化合物之间没有相互作用,则可用其单独作用的结果来预测联合作用。该模型假设在第一种药物中添加第二种药物,仅会影响第一种药物的基线,从而将复杂问题简单化。ZIP在药理学和生物信息学中有很大的应用价值,可用于分析高通量药物筛选数据,并帮助了解药物相互作用并指导联合治疗的发展。但是我们也需要清楚,在现实世界中,药物可以以复杂的方式相互作用,影响彼此的效力或疗效,或者两者兼而有之。ZIP模型和所有模型一样,简化了这些交互,使其更易于分析,但是这不意味着真实世界就是这样的。
公式y_{ZIP}=\frac{(\frac{x_{1}}{m_{1}})^{\lambda _{1}}}{1+(\frac{x_{1}}{m_{1}})^{\lambda _{1}}}+\frac{(\frac{x_{2}}{m_{2}})^{\lambda _{2}}}{1+(\frac{x_{2}}{m_{2}})^{\lambda _{2}}}-\frac{(\frac{x_{1}}{m_{1}})^{\ ...
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使用微信公众号编辑器有一个十分头疼的问题:粘贴出来的代码,格式错乱,空间小还带行号,而且特别丑。Markdown.com.cn编辑器能够解决这个问题。
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2 Markdown语法教程2.1 标题不同数量的#可以完成不同的标题,如下:
一级标题二级标题三级标题2.2 字体粗体、斜体、粗体和斜体,删除线,需要在文字前后加不同的标记符号。如下:
这个是粗体
这个是斜体
这个是粗体加斜体
~这里想用删除线~~
注:如果想给字体换颜色、字体或者居中显示,需要使用内嵌HTML来实现。
2.3 无序列表无序列表的使用,在符号-后加空格使用。如下:
无序列表 1
无序列表 2
无序列表 3
如果要控制列表的层级,则需要在符号-前使用空格。如下:
无序列表 1
无序列表 2
无序列表 2.1
无序列表 2.2
由于微信原因,最多支持 ...
Highest Single Agent
简介Highest Single Agent(HSA)模型可用于评估化合物/药物联合作用。该模型通过将组合中最有效的单一化合物/药物作为组合效果的基准来评估药物组合的有效性。本方法不同于Bliss、Loewe等方法,本方法是一个概念,不是具体由某人发现的。这种方法得到的结果趋于保守,忽略了化合物组合的协同效应。
公式E_{AB}=max(E_{A},E_{B})CI=\frac{max(E_{A},E_{B})}{E_{AB}}从公式上,我们可以得出以下结论:对于两种化合物,预测的联合效应仅为单个化合物效应最大值,其预测结果存在相当大的保守性。比如当两化合物在效应上存在强协同,则实际观测结果必然大于预测值。
优缺点优点:1.可计算CI指数2.得出的结果趋于保守(或结果乐观)
缺点:1.基于效果的方式2.在组合中,没有考虑两种化合物的加和效应;3.仅适用其中一种药物对所有测试浓度均无活性的药物组合
Bliss Independence
简介Bliss独立作用模型是由Colin Bliss在1939年开发的。该模型基于药物相互独立作用的假设来评估药物的组合效果。本模型的主要概念为,假设两种药物之间没有相互作用,可以通过乘他们的单独效果来预测其在组合中的效应。该模型的应用范围广,可用于评估潜在的药物相互作用。
公式本模型假定药物之间没有相互作用,则联合作用可表示为单独作用的综合减去其单独作用的乘积。
E_{Bliss}(a,b) = f_{A}(a) + f_{B}(b) - f_{A}(a)\cdot f_{B}(b)CI=\frac{E_{A}+E_{B}}{E_{AB}}学习过概率论的朋友应该清楚,这个公式和加法公式没有什么区别:
P(A+B) = P(A) + P(B) - p(AB)对于Bliss模型,该模型特别用于确定化合物组合中的协同作用。如果发现观察到的联合效应E_{observed}比预测的联合效应E_{predicted}高,则说明其是协同效应,反之则为拮抗效应。但是,这种方式缺乏统计的严谨性。通常会产生假阳性的协同作用。
优缺点优点:1.使用范围广2.可以计算CI指数3.根据基本假设,兼顾两种药物的 ...
企业介绍——Diageo(吉亚蒂欧)
基本信息 General InformationDiageo 是全球酒精饮料的领导者,用用200多个烈酒和啤酒品牌。该公司在近180个国家开展业务,雇佣30000+员工。该公司的产品组合包括业内一些知名和最受欢迎的品牌,如尊尼获加、吉尼斯、Tanqueray、和百利等。该公司的战略重点是优质饮料,这是最具活力和最令人兴奋的消费品类别。
Diageo is a global leader in alcoholic beverages, boasting over 200 brands across spirits and beer. The company has a significant presence worldwide, with operations in nearly 180 countries and employing over 30,000 individuals. Diageo's portfolio includes some of the most well-known and beloved brands in the industry, such a ...
科研人の初体验(二)
我刚看文章的时候,因为底子薄。就和夏洛特烦恼的大爷一样,“什么冬梅” “马什么梅” …… 往往是看了下一句就忘了上一句。英文更别提了,生词先不说,就算每个单词都认识,串联在一起就不知道什么意思了。
我记得高中英语有这样一种题型,给你一段文章,让你寻找可以替换的单词。不认识单词其实没问题,阅读完整篇文章后,再思考一下就很容易选出正确答案。阅读英文文献也差不多,整明白了标题和摘要就大概知道这篇文章是什么了。对了,别忘了关键词!关键词除了能帮你快速定位这篇文献是否是你需要的文献,也能帮你建立你自己的文献库索引!
大部分的论文行文思路一般是:引言,材料方法,结果与分析和结论。然后再确定这篇文章是否需要精读,如果需要精读就办它!
初级精读创建思维导图(这里推荐使用draw.io 用过的都说好)。按照文章的行文顺序,解决以下几个问题:
121.作者要解决什么问题,即问题的背景2.作者是如何解决这个问题的
带着这几个问题去阅读全文,然后完善思维导图,这就是初级精读的方法啦。随后只要看思维导图就能回想到这篇文章的内容啦!
深度精读深度精读,除了对文章的内容进行掌握,也要学习这篇文献是如何写的。对用词、 ...
科研人の初体验(一)
百炼方能成钢!在科研这条道路上,需要有坐得住的决心。这条路上最重要的一环,恐怕就是文献积累了。无论你是硕士研究生还是博士研究生,在任何一个小topic上钻研了100余篇左右的核心文献,你都会成为这个领域的专家(货真价实的专家,不是砖家哦)
从浩如烟海的文献中,找到这百篇文献也不是什么易事。不过正如那句话说得好,车到山前必有路,船到桥头自然直。只要想解决这个问题,就一定能干掉它!
以下是总结的一些方法论,仅供参考:
第一步:搜索中文综述论文,还是母语亲切。搜索相关研究内容的“综述” “meta分析” 等,就会找到一些比较基础的综合性文献。
第二步:查找英文综述论文,步骤与第一步类似。搜索相关的英文综述就可以找到类似的文章。到目前为止,现在应该有十几篇文章参考了。
第三步:根据引用量,从高到低进行排序,引用量多的往往都是这个topic的奠基文献,所以要仔细读,深入读,玩了命地读现在我们大概有多少篇文章了,我想应该有60多篇文章了吧?
第四步:滚雪球大法!在深入阅读这60多篇文章的时候,会发现有一些文章也很重要,但是在刚才的文献库里没有,那么就add up !!!
细胞计数及计算程序分享
如何正确使用血球计数板视频来源:B站视频制作:京师出版
基本原理血球计数板最早是由19世纪法国解剖学家(anatomist)Louis-Charles Malassez 先发明的,当时他用来计量血细胞。血球计数板的基本原理是,在已知大小的方格网中,先确定每个小方格中的微生物,再换算成每毫升菌液(或每克样品)中微生物细胞的数量。
简单来说,就是固定体积来数其中的细胞个数,再计算其浓度。
那么这个体积是如何确定的呢?
一般的血细胞计数板是一个大H形状,分为上下两部分。无论是上面还是下面其微观结构都如图C所示。其中按照内部大格子的多少分类,又可分为汤麦式 (图D,大方格内分为25中方格,每中方格又分为16小格,即25 X 16)和 希利格式(大方格内分为16中方格,每一中方格又分为25小格,即 16 X 25),总之一共就是400个小格子。
而我们的计数区域边长为1mm ,面积为1mm^2,盖上盖玻片后,计数室的高度为0.1mm,所以计数室体积是固定的0.1mm^3(0.1*10^-3 ml)而每个小方格的体积为1/4000 mm^3.
现在我们只需要选择正确的计算公式,以及数清 ...